Сайт платных услуг ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России


Лаборатория молекулярной онкологии


Лаборатория молекулярной онкологии – молодое подразделение ФГБУ «НМИЦ ДГОИ имени Д. Рогачева» Минздрава России, созданное 1 июля 2019 года с целью обеспечения молекулярно-генетической диагностики солидных опухолей у детей и проведения научных исследований в данной области. Опухоли центральной нервной системы и экстракраниальные солидные опухоли составляют большинство онкологических заболеваний у детей и подростков, характеризуясь при этом значительным разнообразием нозологических форм и клинических проявлений. Дифференциальная диагностики некоторых из них возможна только с помощью выявления специфических молекулярно-генетических маркеров, поскольку опухоли имеют сходное морфологическое строение и иммунофенотип. Определение диагностических маркеров – патогномоничных генетических аберраций составляет первую задачу лаборатории.

 

Внутри одной группы опухоли могут иметь различную агрессивность, что напрямую влияет на прогноз заболевания. Для проведения риск-адаптированного лечения необходимо выявление прогностических биологических (в том числе, молекулярно-генетических) маркеров в дебюте заболевания. Такой подход позволяет проводить агрессивное многокомпонентное лечение пациентов групп высокого риска и редуцировать интенсивность терапии у пациентов с прогностически благоприятными опухолями, благодаря чему удается добиваться максимальной эффективности лечения и избегать избыточной токсичности.

 

Ряд пациентов групп высокого риска являются кандидатами для проведения индивидуализированного лечения, поскольку они исчерпали запас эффективности стандартных методов терапии. Тактика лечения подбирается на основании биологических свойств опухоли – мутаций, запустивших онкогенную трансформацию клетки и поддерживающих ее злокачественный фенотип. Такая терапия носит название молекулярно-направленной или таргетной, она эффективна только при наличии мишени – активированного онкогена или блокированного онкосупрессора. Выявление маркеров чувствительности к препаратам молекулярно-направленной терапии (предиктивных маркеров) составляет третью задачу лаборатории.

 

Для достижения указанных задач в лаборатории используется полный спектр современных методов исследования нуклеиновых кислот – ПЦР в режиме реального времени, цифровая капельная ПЦР, множественная лигазно-зависимая амплификация зондов (MLPA), секвенирование ДНК по Сэнгеру, гибридизация ДНК и РНК на чипах высокой плотности, высокопроизводительное секвенирование таргетных панелей генов, секвенирование РНК.

В рамках клинической и научной деятельности в лаборатории осуществляется:

  • анализ дифференциально-диагностических и прогностических маркеров глиом различной степени злокачественности, медуллобластом, редких (эмбриональных, сосудистых) опухолей ЦНС; исследование циркулирующей опухолевой ДНК при высокозлокачественных глиомах
  • поиск патогномоничных маркеров костных и мягкотканных сарком
  • исследование прогностических маркеров эмбриональных экстракраниальных опухолей (нейробластома, нефробластома), маркеров ответа нейрогенных опухолей на терапию и феномена эпителиально-мезенхимального перехода
  • установление клинико-лабораторных корреляций между молекулярно-генетическими маркерами, течением заболевания и ответом на проводимую терапию совместно с врачами – детскими онкологами

 

Отдельным направлением деятельности, осуществляемом в содружестве с лабораторией молекулярной биологии, является исследование наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям. В лаборатории молекулярной онкологии осуществляется поиск несбалансированных геномных аберраций и аномалий числа копий генов, ассоциированных с риском развития злокачественных опухолей.

 

Сотрудничество: Лаборатория молекулярной онкологии в рамках осуществления первичной молекулярно-генетической и референс-диагностики сотрудничает с большинством центров детской онкологии и гематологии России. Лаборатория имеет близкие и активно развивающиеся международные научные контакты с Princess Máxima Center for Pediatric Oncology (Утрехт, Нидерланды), Uniklinik Köln (Кёльн, Германия) в области диагностики нейробластомы, National Center for Child Health and Development (Токио, Япония) – исследование сарком мягких тканей, Children's National Hospital  (Вашингтон, США) – анализ опухолей ЦНС.

 

Участие в конференциях: Сотрудники лаборатории регулярно принимают участие в профильных национальных и международных конференциях, представляя результаты работы в виде постерных или устных сообщений. Среди крупных форумов можно выделить Российский онкологический конгресс, Международный онкологический форум «Белые ночи», конгрессы Международного общества детских онкологов (SIOP), Американской ассоциации по исследованию рака (AACR), Европейского общества генетики человека (ESHG), Международный симпозиум по детской нейроонкологии (ISPNO).

 

Публикации: результаты научной работы сотрудников лаборатории публикуются в основных профильных российских и зарубежных периодических изданиях, таких как «Вопросы онкологии», «Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии», «Успехи молекулярной онкологии», «Pediatric Blood and Cancer», «Journal of Cancer Research and Clinical Oncology», «Journal of Clinical Oncology – Precision Oncology

 

 
кандидат медицинских наук заведующий лабораторией –



ПЕРЕЧЕНЬ ГЕНОВ И ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, ДИАГНОСТИРУЕМЫХ ОТДЕЛЕНИЕМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ОНКОЛОГИИ* (К П.58 )
ПЕРЕЧЕНЬ ГЕНОВ И ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, ДИАГНОСТИРУЕМЫХ ОТДЕЛЕНИЕМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ОНКОЛОГИИ* (К П.58 )
Заболевание  Kод услуги  Названия генов  Метод исследования  Количество исследований на 1 образец Стоимость исследования (руб.)
Выявление соматических мутаций. Материал - ткань опухоли в парафиновом блоке
Нейробластома  58.5.1  Делеции 1p, 2q, 3p, 9p, 11q, увеличение числа копий (амплификации) 2p (MYCN, ALK), 17q, несбалансированные аберрации хромосом 4,7,12,14 MLPA 3 42 900
 58.7.1  Мутации в генах, значимых для НБ (ALK, ATRX, CDKN2A, CDKN2B, CIC, FGFR1, HRAS, KRAS, NF1, NRAS, PHOX2B, PTPN11, TP53, TERT, MET)   NGS Qiageq  1 72 800
 58.9.4  Определение поражения костного мозга на основании экспрессии генов PHOX2B, TH, DCX  ПЦР с обратной транскрипцией  4 9 600
Нефробластома и другие опухоли почек (за исключением рабдоидных)  58.5.2  Делеции 1p, 16q, увеличение числа копий 1q  MLPA  1 14 300
 58.7.2  Мутации в генах, значимых для нефроблатомы (TP53, DICER1, DROSHA, WT1, FBXW7, CTNNB1)   NGS Qiageq  1 72 800
Рабдомиосаркома  58.9.1  Определение экспрессии химерных генов PAX3-FOXO1, PAX7-FOXO1  ПЦР с обратной транскрипцией  3 7 200
 58.7.3  Мутации в генах, значимых для рабдомиосаркомы (TP53, MYOD1, MAP2K1, MAP2K2, KRAS, HRAS, NRAS)   NGS Qiageq  1 72 800
Саркома Юинга  58.9.2  Определение экспрессии химерных генов с участием EWSR1   ПЦР с обратной транскрипцией  7 16 800
Остеогенная саркома  58.5.3  Амплификация генов MDM2, CDK4  MLPA  1 14 300
Злокачественная опухоль из оболочек периферических нервов  58.5.4  Делеция гена NF1  MLPA  3 42 900
 58.7.4  Мутации в гене NF1, TP53, CDKN2A, BRAF  NGS Qiageq  1 72 800
Злокачественные рабдоидные опухоли  58.5.5  Делеции гена SMARCB1  MLPA  1 14 300
 58.7.5  Мутации в генах SMARCB1, SMARCA4   NGS Qiageq  1 72 800
Медуллобластома  58.5.6  Аномалии числа копий хромосом 1-11, 14, 16, 17, 20 MLPA 4 57 200
 58.7.6  Мутации в генах, значимых для медуллоблатомы (TP53, CTNNB1, PTCH1, SUFU, ATRX, SMO, TERT, SMARCA4)   NGS Qiageq  1 72 800
Глиомы низкой степени злокачественности  58.9.3  Определение экспрессии химерных генов с участием BRAF (KIAA 1549- BRAF)  ПЦР с обратной транскрипцией  3 7 200
 58.7.7  Мутации в генах, значимых для глиомы низкой степени злокачественности (TP53, BRAF, TERT, ATRX, FGFR1, IDH1, IDH2, MAP2K1, MAP2K2)   NGS Qiageq  1 72 800
Олигодендроглиома  58.7.8  Мутации в генах, значимых для олигодендроглиомы (NOTCH1, IDH1, IDH2)   NGS Qiageq  1 72 800
Высокозлокачественные глиомы 58.5.8 Аномалии числа копий генов BRAF, IDH1, IDH2, FGFR1, MYB, MYBL1, CDKN2A MLPA 1 14 300
 58.7.9  Мутации в генах, значимых для злокачественных глиом (TP53, BRAF, TERT, ATRX, EGFR, IDH1, IDH2, H3F3A, HISTH3B, POLD, POLE)   NGS Qiageq  1 72 800
58.8.3 Мутации K27M в гене H3F3A ПЦР 1 5 850
Эпендимома  58.5.9  Аномалии числа копий хромосомы 1q MLPA 1 14 300
Фибромиксоидная саркома низкой степени злокачественности 58.9.5 Определение экспрессии химерных генов FUS -CREB3L1 и FUS -CREB3L2  ПЦР с обратной транскрипцией  10 24 000
Инфантильная фибросаркома 58.9.6 Определение экспрессии химерного гена ETV6 -NTRK3  ПЦР с обратной транскрипцией  1 2 400
Исследование драйверных мутаций в ткани опухоли  58.7.10     NGS Qiageq  1 72 800
Исследование маркеров чувствительности опухоли к молекулярно-направленной (таргетной) терапии  58.7.11     NGS Qiageq  1 72 800
Мутации, выявляемые при различных видах онкологических заболеваний  58.8.2  Мутация V600E в гене BRAF ПЦР 1 5 850
 58.8.4  Поиск мутаций в гене KRAS (экзоны 2,3,4), NRAS (экзоны 2,3,4) ПЦР 2 11 700
 58.8.5  Поиск мутаций в гене IDH1(экзон 4), IDH2(экзон 4) ПЦР 2 11 700
Выявление герминальных мутаций. Материал - периферическая кровь / буккальный эпителий
Туберозный склероз  58.5.10  Делеции генов TSC1, TSC2 MLPA 2 28 600
Анемия Фанкони 58.5.29 Делеция гена FANCA  MLPA 1 14 300
Синдром конституционального дефицита восстановления комплементарных пар нуклеотидов  58.6.1  Делеции и аберрантное метилирование генов PMS2, MLH1, MSH2, MSH6 MLPA, MS-MLPA 3 42 900
Синдром Линча  58.5.11  Делеции и аберрантное метилирование генов PMS2, MLH1, MSH2, MSH6 MLPA 3 42 900
Синдром Пейтца-Егерса  58.5.12  Делеции гена STK11 MLPA 1 14 300
Синдром PTEN-гамартома, синдром Коудена, синдром Банаян-Райли-Рувалькаба  58.5.13  Делеции в гене PTEN MLPA 1 14 300
Синдром наследственной параганглиомы-феохромоцитомы  58.5.14  Делеции генов SDHx MLPA 2 28 600
Наследственная ретинобластома / остеогенная саркома (вторая линия диагностики после секвенирования)  58.5.15  Делеции гена RB1 MLPA 1 14 300
Синдром Ли-Фраумени (вторая линия диагностики после секвенирования)  58.5.16  Делеции гена TP53 MLPA 1 14 300
Синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям 1  58.5.17  Делеции гена SMARCB1 MLPA 1 14 300
Нейрофиброматоз 1 типа  58.5.18  Делеции гена NF1 MLPA 3 42 900
Нейрофиброматоз 2 типа (вторая линия диагностики после секвенирования)  58.5.19  Делеции гена NF2 MLPA 1 14 300
Синдром WAGR / Дениса-Дрэша  58.5.20  Делеции гена WT1 MLPA 1 14 300
Синдром Беквита-Видемана  58.5.21  Делеции и аберрантное метилирование генов IGF, H19 MLPA 2 28 600
Синдром фон Хиппеля-Линдау  58.5.22  Делеции гена VHL MLPA 1 14 300
Валидация данных NGS, поиск мутации у родственников пациента  58.11.2    Метод Секвенирование по Сэнгеру 1 5 850

Код Наименование Стоимость
Внимание!

В прайсе представлена стоимость конкретных единичных услуг, вряде случаев для получения результата может понадобиться их комбинация. В связи с этим финальная стоимость может быть уточнена при записи.

Цены на все платные услуги Центра.

Сроки предоставления медицинских услуг.